2001年3月，学校成为黑龙江首批高职院校之一万博全站(ManBetX)，校名为齐齐哈尔职业学院。2011年，学校经教育部批准升格为普通本科高校，更名为齐齐哈尔工程学院，成为齐齐哈尔市第一所市属本科大学。目前，学校已发展成为以工学学科为主，管理学、医学、艺术学等学科适度发展的全日制应用型本科院校。学校系全国唯一具有行政级别、事业单位编制的民办高校。
