据珠江委介绍，4月16日以来，珠江流域发生大范围强降雨过程，流域中部东部地区普降中到大雨，部分地区暴雨至大暴雨。受强降雨影响，北江干流及支流共40条河流发生超警洪水，超警幅度0.01米至5.58米。4月20日20时45分，北江干流石角站流量涨至12000立方米每秒，相应水位8.12米，达到水利部《全国主要江河洪水编号规定》的标准，北江发生2024年第2号洪水。
事实上，早在M503航线设计评估之初，中国民航局就已经考虑到了新航线不能与金门和马祖两地直飞台湾本岛的航线相冲突，因此M503航线上班机的飞行高度被控制在9000米以上，而金门和马祖往来台湾岛的W2、W6及W8航线班机的飞行高度则只有6000米左右，二者在垂直距离上相差3000米左右，根本就不存在所谓“飞行安全”的问题。
